GB版和PS版都是對FC版第二次機戰的重制。
FC的第二次機戰是真正意義上引入完整劇情線的機戰，從第二次機戰到機戰F完結篇，所有這幾個機戰的世界觀都是一樣的，劇情也是連續的，所以第二次，第三次，EX，第四次（機戰f）這幾作又叫DC戰爭系列。後來的機戰這樣出了一個作品以上的，劇情連續的，共用世界觀的機戰還有幾個，比如z系列，Alpha系列等等。
FC的第二次因為整個機戰系列都還有一定的不成熟，所以劇情和整個遊戲得完成度都不是特別理想，所以才有了後來的GB版和PS版。
GB版其實是利用了第四次機戰的系統，又加入了v高達，g高達，把劇情重新串聯以後出的。系統方面，第四次機戰引入了機體改造和武器改造系統，所以GB版繼承了這兩個系統，FC版沒有這個系統，只有一個寶物商店系統，在系統上幾乎可以認為和後來的機戰沒什麽關系。FC的第二次真正開創的被保留的是機師和精神，第一次機戰裏沒有機師，而且也只有一台主角機可以用精神，精神還是隨機的。但是FC第二次機戰首次引入了機師，而且精神變成了每個人都能用，這個被後來的機戰繼承下來了。
不過第四次機戰在地圖上有隱藏道具，沒有任何標識，需要你自己一格一格摸索或者使用特定精神發現，這個GB版沒有繼承。GB版機體改滿以後可以獲得特殊能力，但是沒有強化零件。
從劇情上，GB版其實更有趣，因為加入了V和G兩個作品，G高達在當時還是個挺火的動畫，GB版直接引入了還是個在當時看挺奪眼球的事。
不過，G高達後來又加入了新機戰和後來的機戰F，新機戰世界觀獨立，還好說，F系列和第二次是一個世界觀，本來之前說GB版的劇情才是真正的劇情，FC版劇情是一個不全的黑歷史，結果到F裏G高達又加入了作品，而且情節和GB版沖突，最後搞的GB版的劇情成為了黑歷史了。
但是這仍然無法掩蓋GB版的精彩，老機戰裏值得一玩的機戰肯定得有GB版的第二次機戰一份。
而PS版的第二次是這樣，當時winkysoft傾盡全力以第四次機戰為底子，做出了機戰F系列，這一作的系統完成度非常高，後來幹脆w社就把第二次，第三次和EX都用機戰F的系統重做了一遍，遊戲系統全換成F的，但是劇情完全沒改，算是更新了一遍。當年機戰F的說明書最後還有這幾作的廣告。
整體上，畫面最好的肯定是PS版的第二次，但PS版劇情和FC版幾乎一樣，GB版雖然畫面不太行，還是黑白GB，但劇情其實分量挺足的。
區別大體是這些吧。
