想看魏晋南北朝，那肯定首推南京啊（因为同时期的另一个大城邺城已经消失在历史中）。
现存的遗迹主要是南京的栖霞山佛教摩崖石刻和分布在南京丹阳句容三地的六朝石刻，还有一些零散的，比如南京灵谷寺中的宝志和尚墓，同在紫金山里的六朝祭坛遗址，以及散布在南京周边的六朝墓葬遗址。
至于始建于南朝的栖霞寺，被吹成南朝第一寺的鸡鸣寺，现存建筑都是清朝的（连明朝都不是）甚至现代新建的。甚至鸡鸣寺根本不是南朝第一寺的同泰寺，同泰寺也不在鸡鸣寺现在的地方。
刚看了其他答案，这才想起来，南京还有两处六朝时期活文物。一是另一个答案已经说的，东南大学校园里的六朝松，传说是梁武帝亲手种下，这个无法考证，但研究发现这棵松树的确是从六朝时期开始生长的。可惜这棵老松就像病危老人一样，无比苍老，靠柱子撑着，有点像在ICU里吊命的感觉。二是浦口区惠济寺里的三株银杏树，据说是昭明太子萧统（梁武帝儿子）所种，虽然历经一千多年，但每到金秋十月，三株银杏树都满树金黄，散发着旺盛的生命力，非常壮观。
专题博物馆的话，南京有六朝博物馆，这个是南京市博物总馆下面的一个分馆（市级），主打南京六朝文物，就在总统府隔壁，现在也是网红打卡地，人多的一比。其次是东晋博物馆，其实就是江宁区博物馆（区级），虽然叫东晋博物馆，但主要展现江宁区的通史（当然也包括六朝那段时期的）。基本没啥人，但文物本身的质量和数量也不高，毕竟是区级博物馆哈。
最后补充一个，据说上坊的东吴大墓将建遗址博物馆，虽然这属于三国时期，不过也勉强复合题目要求了吧
