（多圖預警~）
勉強回答一下：
寶可夢「自古以來」就是攻擊人類，且一度被認為時「危險可怕」的生物，這在遊戲正作【寶可夢傳說：阿爾宙斯】中就有明確刻畫，而且在後續衍生作品（包括但不限於動畫、電影等）也不斷得到呼應和佐證，前後是統一的。
寶可夢自古以來就是「可怕的生物」：從洗翠地區開始
先不考證人類起源時期的情況，就人類文明發展到一定程度之後， 寶可夢這個名詞出現後相當長的一段時間之中，依然被視為「可怕」的生物 。
這不僅僅是玩家/觀眾（包括我自己在內）的感覺，也是當世之人的「共識」， 無論是隊長馬加木還是拉苯博士，對於寶可夢很「可怕」這一點都深信不疑，調查組的人員無論新老，也認為寶可夢甚至是「野外」都很危險…… 洗翠地區人們的遭遇為我們提供了絕佳的人類寶可夢關系素材。
（順便問句這作時間線官方設定的是在多少年之前啊，就顧著玩了，沒太留意這些，請大神們不吝賜教）
野外的寶可夢會主動襲擊人類 （雖然也有溫馴的個體和親近人類的寶可夢）， 但是野外人類遭到攻擊時自古以來的常態 。盡管嚴格意義上，絕大多數寶可夢和人類似乎並不是「捕食/被捕食」的關系，但是被襲擊應該是司空見慣的事情。
神奧地區的祝慶市——前身是洗翠地區的祝慶村——就是人類「抱團取暖」的產物 。祝慶村建立之初，很大程度上就是人類建立的「根據地」，設有各類寶可夢調查組和門衛，用以研究寶可夢，盡量減低潛在的風險。
Pokemon世界中的古人們大多都有在野外被野生寶可夢所襲擊的經歷 。比如小照曾經被電擊擊中失去知覺，人類很多時候都是要用血肉之軀去「扛」各類寶可夢技能的，古代的世界自然是比較危險的，所以出門要多加註意。
事實上，如果你「穿越」到古代，那麽體驗也大致如此，沒有多少誇張成分 。盡管你可能並沒有表現出多大惡意，甚至沒有做出什麽想要戰鬥或者收服的舉動，只是想在旁邊采摘一下樹果、收集一下礦石或者看看風景，都會莫名其妙地被各種招式往臉上招呼……
可能是感受到了自身的領地遭到了侵犯，或者覺得自身的幼崽受到了威脅，或者感受到什麽敵意， 或者說單純就看你不順眼，寶可夢就會直接攻擊人類……
大家要明白，洗翠地區至少還有精靈球，雖然簡陋，雖然不成熟，但是起碼還能用，在精靈球發明之前，人類是直接將寶可夢稱為「魔獸」的 。那個時候不僅僅人類日子不好過，而且相互之間關系緊張，寶可夢一旦被人類收服（無論什麽方式），日子也會很慘。
野生寶可夢會連人類和其寶可夢一同攻擊
野生寶可夢並不會區分「訓練師」和「其他人類」，會「一視同仁」，直接加以攻擊 。即使你覺得你自己很懂「寶可夢」，也曾與寶可夢朝夕相處甚至有自己的搭檔，但是在寶可夢眼中並沒有什麽區別，都是人類，都有「襲擊」的可能性，並不會有什麽「區別對待」，該遭到攻擊還是會遭到攻擊，躲也躲不過……
即使你有搭檔寶可夢，也會連同你的寶可夢一起攻擊，而且是字面意義上的「圍毆」，沒有日後現代寶可夢對戰中的各類規定保護 （比如不能下太重的手，不可勉強寶可夢上場等），而且野生寶可夢可是個個「不講武德」，經常「以多打少」，而且絲毫不懂得「點到為止」，一旦人類（無論是否是訓練師）也在野外遭遇寶可夢「群毆」，輕則傷筋動骨，重則……
有些事情到今天也是一樣的，比如野生寶可夢對人類搭檔寶可夢並無絲毫憐憫之意，會優先攻擊 。直到現在精靈圖鑒中，都保留了這樣的描述。
以至於小智踏上旅途的時候，最初都是被烈雀們「圍毆」（因為扔石頭），同時也「連累」了皮卡丘 （當然後來因禍得福兩人接下身後友誼），很多寶可夢（雖然不是全部）對人類自然談不上有多少好感， 攻擊人類更是常態，至今依然如此 。
所以，如果你生活在古代，正確的做法是出門盡量和門衛打招呼，一旦一去不歸，也有人趕緊反映問題，派人增援 。即使在現代，也有很多人表示人類其實並不真正理解寶可夢的喜怒哀樂。而當代訓練師中也有很高比例被自己飼養的寶可夢（不是野生）攻擊的記錄，人類被寶可夢攻擊並不是什麽「新聞」 。
即使當代Pokemon世界中，也不乏直接攻擊訓練師的案例
現代的精靈聯盟，更側重於在不傷害寶可夢和訓練師的情況下進行「公平競技」。 所以，實際上在道館戰、聯盟大賽賽場上根本沒有那種真正「戰鬥」，才會產生寶可夢不能攻擊人類的錯覺 。
這就是典型的和平年代的想法，真正戰鬥的時候，核心戰術之一都是直接「控制」對方訓練師，直接癱瘓對手有生力量 （精靈球中的寶可夢），而真的像道館戰、聯盟大賽那種「公平競技」的情況很難在實戰中發揮出來：
即使是在當代，人類飼養的寶可夢，真正用來實戰的時候，都不會忌諱對面是人類 ，這還是人類能夠控制的情況下。就不要說野生寶可夢，根本沒有什麽競技的觀念，就是純粹的動物行為驅使下，對人類能夠保持多少理智。
所以，綜上所述 ，寶可夢完全可以攻擊人類，而且從古至今，從野生寶可夢到人類飼養的寶可夢，都存在攻擊人類的行為 ，只不過道館戰和聯盟大賽，一半出於培養訓練師的教育目的，一半出於寶可夢對戰的競技目的，不允許這種行為發生罷了，真正寶可夢用於實戰的時候，人類可能往往被寶可夢更先遭殃……
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