題主，不要懷疑自己。 這不是你的問題。歐美遊戲的劇情本來就不是那麽容易讓人看懂的。
我可以負責任地告訴你，在知乎上你能看到的那些常寫歐美遊戲的人們他們之所以一個個看起來都很懂的樣子，是因為他們平時私下都是要經常開組會討論劇情的。 每期組會都會有那麽幾位要上來做主題報告，透過自己從各種渠道收集的資料來把這些遊戲的劇情用比較簡單易懂的語言講出來。其他人則會發問。那些問題就和你在題目說明中列出來的問題差不多，都是一些玩完遊戲之後本來覺得自己應該能懂但仔細一想又全都不懂的問題。
如果你去參加過這些人的組會你就會知道，事實上歐美遊戲在敘事過程中有各種各樣的問題，有些是故意打亂了事件順序，並大量穿插記憶（吸歐弟黑色行動子系列，黑色洛城），有些是故意抽取記憶節點但不敘述完整過程（R星所有遊戲），有些是故意放敘述詭計或強行多視角（量子夢的大多數遊戲，生化奇兵），有些是有多層故事巢狀並且還吃書（刺客信條），有些是過於依賴玩家對系列背景知識的了解（所有著名的歐美RPG系列）……此外，還有一個重要問題是玩家遊玩的全過程裏，花在理解劇情上的時間占比很少，大部份的遊戲時間都花在移動，戰鬥等動作上，而這些動作或操作部份是和劇情沒有什麽關系的。
當這些問題加在一起，你能馬上搞清楚遊戲的劇情才比較厲害。
你舉的例子是RDR2——R星的遊戲可是這方面的重災區。如果你之前沒玩過R星的遊戲，不熟悉他家這套只呈現重要記憶節點，不串聯中間過程，玩家必須註意聽角色每一句對話才能部份還原真實事件經過的手法的話，那感到茫然是絕對不可避免的。
而說實話，RDR2已經算好的了。不信你可以去玩玩GTA4，看看R星早年是怎麽幹的。當然你也可以試試Bully，但Bully當中不同勢力的形象比較臉譜化，這方面問題小一點。
你還提到了暗黑二代三代和上古5。這倆系列都要求你懂lore，而且還不只如此，上古是有一套自己的神學觀的。這部份內容在上古5貼吧有很多討論，被尊稱為N姐的nihilee貢獻了很多重要論述，包括【成神之路】和【Aka之後的那些時間軸】。如果你不知道這些的話，上古5也還是能照樣玩，但會影響你對這個世界的不少重要認識，比如龍是哪來的，為什麽刀鋒會要屠龍，和天空神廟有關的那些蛇人是怎麽回事等等。至於暗黑二代和三代……暗黑2在遊戲內部是沒有lore或codex的（3代有沒有我忘了），也就是說如果你沒經歷過一代的話，你至少會面臨如下重要問題：崔斯特瑞姆是誰？肯恩是誰？肯恩是幹嘛的？為什麽莉婭後來不見了……等等。
樓下大魚哥提到 @王澍 兄的上古系列科普。你可以去看看，但別忘了這樣一個重要細節，你把定位條拉到他答案的最下方，看看答案的釋出和修改時間：
看到了嗎？對於這樣一個對歐美RPG幾乎所有主流設定集都如數家珍的大佬，寫這樣一篇答案都花了他半年的時間。
所以題主，不要懷疑自己。這些內容都是大家群策群力，一起商量才能搞清楚的。你只有自己一個人，搞不清楚很正常。如果你還是喜歡遊戲，那就還是繼續玩。怕什麽真理無窮，進一寸有一寸的歡喜。
當然你也可以見識一些在敘事方面更極端的遊戲。一個見過大海的人，是不會被眼前的小水塘困擾的。
