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有什麽好用的生物醫學科研【線上】小工具?

2019-06-10健康

推薦生物醫學科研生最值得收藏的幾個寶藏—— 影片學習網站,文獻網站,處理工具

一、影片學習網站:

1、Osmosis

這是一個非常有趣的影片網站、采用動畫模式講解疾病的發生機制。醫學小白必入的寶藏網站。

可以透過Osmosis編制的影片、遊戲、互動課件和實驗現場來學習醫學知識。這些資源都由有能力的學者、醫生和教育家編寫而成,透過這些資源可以有效地鞏固知識點。

2、DNA from the begining

提供DNA、基因、基因組成等方面的線上教程,將遺傳學的復雜科學原理變得簡單易懂,而且較為生動地教授了DNA的重要性及其對我們的生命的影響。

學習者可以了解DNA的基本結構和功能到生物技術和人類遺傳研究,包括DNA如何編碼為蛋白質,如何實作基因轉錄和轉譯,以及有關基因突變、人類遺傳衰變和藥物治療的最新發現。

3、Cellsalive

Cellsalive網站囊括了細胞的各個層面,包括細胞的結構、功能、分裂等方面的內容。它提供了豐富的影像、動畫和影片,以表達細胞結構和功能的復雜性和多樣性。特別地,非常適合教師使用該網站的各種資源設計和制作更好的互動教學課程,激發學生對生命科學的熱愛和興趣。

4、Geeky medics

大量的醫學課程和培訓內容,涵蓋了從解剖學、生理學、病理學到藥物治療等各種方面的知識。提供了大量的演示和模擬軟件,以幫助醫學生和實習醫生實踐真實臨床場景的套用技能。其中包含了虛擬患者。

免費免費,收錄內容豐富,主要是臨床基礎醫學知識內容。最大的特點是可以把內容做pdf都打印出來。

5、醫學微觀

介紹了細菌學、病毒學、寄生蟲學以及真菌學等領域的知識,提供了大量的精美圖示以便使用者更好地理解微生物學中的復雜概念和過程。還提供了病原體的介紹、傳播途徑、臨床表現、預防和治療等相關知識,是一個非常好的醫學微生物學素材庫。

二、資訊、文獻網站:

PubMed、sciencedirt等這些常用的就不介紹了,一下介紹幾個針對生物醫學的網站。

1、MedScape

提供了關於醫學、健康和醫療新聞及專業資訊、研究報告等廣泛的資訊,例如醫學研究進展、藥物資訊、臨床實踐知識等方面的內容,同時還提供疾病診斷和治療方案、病例研究等領域的資訊資源。

是一個非常有價值的醫學資訊共享平台,幫助醫生和醫學工作者掌握最新的醫學動態和研究成果。

2、PubMedPro

提供了一個非常大的醫學文獻數據庫,包括了近3000多個期刊。包括醫學、健康、生物學、工程等多領域的期刊文章。可以快速地搜尋、篩選、閱讀全文和下載文獻的摘要資訊。

提供了類似韋恩圖等視覺化的工具,把醫學科研數據、文獻和研究成果整理整合成系統性的框架。

三、處理工具

1、生物小算盤NEBioCalculator

多功能的線上工具,可用於處理DNA、RNA、蛋白質等生物分子的序列和結構。提供了多種實驗工具,包括PCR引物設計、反應體系最佳化、序列反轉、修剪、計算Tm值等。同時也支持限制酶切位點預測、雙雜合分析、蛋白質分子量計算等分子生物學實驗計算。

2、基因結構視覺化工具Exon-lntron Graphic Maker

根據輸入的基因序列,自動生成基因的外顯子和內含子結構圖,可以輸入多個基因資訊進行比較,也可以調整圖形顏色和樣式,包括線條、字型和標註等,使基因結構圖更加美觀易讀。

3、基因資訊平台Genecard

基於世界各地多個數據庫以及多項文獻的綜合數據,包括百科全書、基因診斷、藥物靶點和臨床研究等。提供了大量的基因資訊,如基因功能、通路資訊,物種分布、編碼蛋白等,還包括疾病、藥物和試劑等基因相關資源。

使用:透過輸入基因名稱、別名、大體特定的序列資訊等,查詢到該基因相關的資訊、疾病、藥物相關資訊等等。

4、蛋白互作網絡String

對於生物醫學研究工作者而言,String成為一個重要的工具,用於鑒定潛在的生物學過程和發現新的藥物靶標。目前包括超過2千萬個蛋白質及其互作關系,並整合了多種高通量實驗技術數據及生物資訊學分析,可用於預測蛋白質互作網絡,並支持蛋白質復合物、代謝通路等各種生物功能分析。

使用:透過搜尋特定蛋白質或者輸入一組織蛋白質進入該網絡,並且系統會自動計算所選蛋白質在網絡中的相互作用情況,提供圖表等多種方式來展示網絡的拓撲結構。

5、引物設計Primer3Plus

這是基因組學或分子生物學實驗設計過程中常用的線上引物設計工具。它是基於Primer3演算法進行設計引物的軟件,但與其它Primer3版本相比,Primer3Plus擁有更友好的界面和更加豐富的功能。

使用:輸入序列、基因等相關資訊入輸入框中,選擇適當的引物長度、Tm溫度範圍、GC含量、目的PCR區域等參數選擇(註意不同PCR反應類別都需要不同參數),並選擇在輸出中需要的其他資訊(如引物質素控制、SNP效果預測、溫度梯度PCR等)。Primer3Plus會自動計算引物特性參數和可能存在的二聚體和反向互補等問題,並生成最優的一組引物。