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1979年，大陆允许「自费留学」后，他以「公派自费」名义留学日本 。在东京 ，周令飞与同学、台湾人 张纯华恋爱。
1982年9月18日，周令飞与张纯华从日本飞抵达台湾，预备结婚。引起两岸舆论关注。在日本机场时，周令飞向媒体声明：此举纯是为了爱情，没任何其他企图，此事与我父母无关， 并退D 。9月24日上午，「在上百名的记者和为数更多的围观者注目之下」，周令飞和张纯华在台北地方法院 公证处举行婚礼。下午在台北国宾饭店 国际厅举行结婚茶会，出席的张家亲友和新闻界人士有一千多人。 中国大陆灾胞救济总会 理事长谷正纲 做为贵宾出席、并祝福周令飞、张纯华二人。
之后，周留在台湾
周令飞事件随后升级为政治事件，周海婴受到了极大的压力。他宣布与周令飞断绝父子关系，后来，他全国人大主席团成员的资格也被取消，他夫人的工作也被停职，直到1986年恢复
