並非都是純種人類，存在一系列亞人種族乃至蟲形物種，非碳基生物包括智械生命與純能生命也有提及。憶泡資訊中更是涉及到一系列匪夷所思的宇宙種族。
構成仙舟聯盟社會的三大基石種族就均屬於亞人種而非純種人類：
天人族
生物學分類為人科 · 天人亞種，樣貌幾乎與純種人類沒有任何差異，但是擁有遠超正常人類壽命極限的悠久且不老的生命，最初由純種人類接受豐饒星神「藥師」的力量影響產生，後又因追隨星神「嵐」使得巡獵的力量介入，兩股力量在這一族身上構成了微妙的平衡。
天人族的身體細胞能夠近乎無限地分裂再生，不斷修復衰老受損的軀體使之始終維持在某個「標準」狀態，某種意義上可以用「全身都是受控的癌細胞」來解釋該族長生背後的生物學原理。但在享有長生的同時，天人族也面對著自出生起身體狀態就在基因層面上被牢牢釘選的困境，這就導致一些先天有身體缺陷的天人族（在仙舟社會該群體被稱作「天缺者」）反倒無法以其他種族能夠輕易接受的技術手段（例如植入侵入式義體、使用藥物調整激素水平）來彌補缺陷，只能在漫長的生命中忍耐殘疾帶來的苦痛。
由於生存時間的過度延長以及情緒劇烈波動等原因造成維系生命力量的失衡，天人族的不朽生命可能會在某一時刻跨越臨界點滑入比死亡更加恐怖的狀態，原本由基因決定的「標準」狀態會被突破，肉體出現極具破壞性且野蠻的生長，個體淪為失去自由意誌的不死活屍，在仙舟文化中該狀態被稱作「魔陰身」，被視為長生種的悲哀終點。籍由某種特殊的也極不人道的方法，也可在受控情況下人工誘發魔陰身，既能維持個體自由意誌不消散，也可以在某種程度上克服天人種生命形式固有的缺陷。
「天人」這一稱謂取自梵語 Deva，音譯為「提婆」，有「天人五衰」之說描述天人壽命將盡時的異狀。「魔陰」則可能取自佛教中的「五十陰魔」概念，代表修行者由五蘊「色受想行識」所生的執著妨害，實際上遊戲文本也有暗示忘情無欲之人可以避免墮入魔陰。
狐人族
生物學分類為人科 · 犬亞種，樣貌上與純種人類的最大差別在於頭顱上多生出一對犬科動物的耳朵（同時保有正常人類的耳部，人均四聲道）以及長有蓬松狐尾，種族整體顏值較高，在其他種族看來狐人族無論男女都稱得上容姿美麗、充滿魅力。狐人還天生擁有敏銳的感官以及不可思議的靈巧反應，仙舟技術部門據此依照仿生學設計了名為「諦聽」的特種探測裝置。盡管也被列入長生種，但狐人族實際並不能做到長生不老，他們的壽命大約在 300~400 年，與天人族相比其實也算是一支「短壽」的種族。
持明族
生物學分類為人科 · 龍脈亞種，長有龍角以及粗大的有鱗龍尾是該族典型的外貌特征。據記載持明族起源自某個海洋世界，其血脈傳承據說可上溯至已歿的不朽星神「龍」。由於持明長生的根源是作為龍祖末裔血脈中流淌的偉力，因此該種族表現出與其他受「藥師」力量影響獲得長生的種族截然不同的罕見長生機制，即「結卵蛻生」——
「在漫長生涯的盡頭，持明會返回古海中，結成珍珠般的卵，靜待破殼蛻生，重以年幼的形態出水落地，如此往復，持明個體永生不滅。但重生後的持明會喪失過去的大部份記憶，因此也稱得上某種意義上的『生命的輪回』。」
這種由成體回歸幼體、不斷迴圈往復的生命周期被認為依賴於持明細胞不斷的分化轉移，雖然並不完美，但這也使持明族規避了大部份長生種無法逃避的「長生病」以及由之帶來的痛苦。
由於不朽星神「龍」已逝，持明族已無法再自然繁衍擴張人口，對於聯盟而言，任何持明族人口死亡都是難以承受的永久性損失。多數持明族人都居住在仙舟「方壺」，此仙舟曾在第三次豐饒民戰爭中遭受重創，因受嵐射向豐饒民聯軍的光矢波及致使近五分之一洞天被毀與大量人員傷亡，目前「方壺」停泊於蘭那地恒星系，執行為期至少十年的修養。
「持明」取自梵語 Dhāraṇī，音譯為「陀羅尼」，指「真言」，即對佛教密語法咒的雅稱。在仙舟與豐饒之民的戰爭記載中，提到了另外三支與聯盟敵對的亞人種族：
步離人
與狐人族一樣是歸類於人科 · 犬亞種的亞人，具有部份犬類的解剖學特征，外形更似猛獸。步離族人以能征善戰著稱，擅長以生物科技制造武器、鎧甲甚至飛船，奴役並改造其他智慧種族在諸多星球間進行劫掠。步離是目前豐饒之民中最強盛的一支種族，也是仙舟聯盟長久以來的大敵，據記載他們至少已與聯盟發生過三次大規模戰爭，戰火蔓延之處滿目瘡痍。
造翼者
生物學分類為人科 · 有羽亞種，推測外形具有鳥類特征，體生鳥羽，能夠飛行。在造翼者文化中，飛行被認為是高貴的種族特征，因此他們自詡為「雲君」，而蔑稱生活在他們世界中的不具備飛行能力的陸行生物為「塵民」，並肆意奴役地行智慧種族為其進行生產。
造翼者是記載中仙舟聯盟最古老的敵人，這份敵對甚至可以追溯到仙舟啟航前的「古國時代」。他們具有高度發達的科技，早已脫離其發源誕生的母星，而是棲居在被稱為「穹桑」的樹狀人工世界中（即一顆汲取星球能源的戴森樹），以其探出的「枝梢」躍遷至其他星球掠奪資源。
仙舟歷史記載中所述的血戰時代「三劫」之一的「火劫」，即是指造翼者軍團對羅浮仙舟發起的侵略，造翼者試圖將其故土穹桑與羅浮上的豐饒神跡建木連線，雙方在不久後爆發了仙舟歷史上最為壯烈的戰爭，勝利的天平曾一度向造翼者傾斜，直到巡獵星神嵐降世出手，射出光矢破壞建木、貫穿巨獸，斷開了羅浮與穹桑的連線，才最終化解一場浩劫。
後來造翼者一族與新興的反物質軍團結怨爆發爭戰（絕滅大君「星嘯」甚至曾要求朱明仙舟放棄抵抗，改變航路協助她攻伐造翼者的世界。造翼者憑一己之力能拉滿正邪兩方仇恨，著實諷刺），他們的根據地一度遭受極其慘重的破壞，故土穹桑亦被伐倒，而造翼者也成了豐饒之民中少見的僱用兵種族。當下有真偽不可考的傳言稱，造翼者的「孔雀天使」軍團已抵達失魂星域，其目標是尋找一顆星核，以復興其衰落的故鄉世界穹桑。
「穹桑」取自「窮桑」，是中國上古傳說中的地名，亦指傳說中的巨桑。【拾遺記】載：「窮桑者，西海之濱，有孤桑之樹，直上千尋，葉紅椹紫，萬歲一實，食之後天而老」。據【帝王世紀】，窮桑是黃帝、少昊、顓頊三帝登基建都之地。「建木」是上古先民崇拜的一種高大聖樹，傳說其生在窫窳西弱水上，最初由黃帝制作，是溝通天地人神的橋梁，黃帝、伏羲等眾帝都是透過這一神聖的梯子上下往來於天界與凡間。
慧骃族
生物學分類為人科 · 有蹄亞種，半人馬亞人種，保有類似馬匹的健碩軀幹，前有雙臂，後有四肢著地，共生六肢，極善奔馳。該族受步離人的蠱惑成為豐饒之民，其族常常擔任步離軍團沖鋒時的先驅，身著生物外骨骼裝甲，能在沖撞間輕易擊殺敵人。
有觀點認為，慧骃原有文明已經遭受了反物質軍團的打擊和奴役，反物質軍團中的人馬形士兵「踐踏者」就是由慧骃族人改造而來。
以上這些種族無論族群特性如何，至少都還是類人生物，而接下來所提到的兩支種族就完全脫離了「人」的範疇，甚至都已經超越通常定義下的「生命」：
視肉
一種具有變形和增生能力的膠狀原蟲，世外妖魔族類中的一支，生物學分類為原質目 · 原蟲科 · 膠狀原蟲亞種。曾是步離人飼養的畜牧物種，後不知為何變異失控（可能是步離人生物武器化改造實驗的結果），成為肆虐星間的災害。
該物種雖然智慧不高但極為致命，行動模式類似病原體，岱輿與圓嶠兩座仙舟就曾慘遭視肉侵蝕，致使人口銳減；在造翼者入侵羅浮的「火劫」血戰中，由視肉聚合而成、受造翼者驅策的巨獸艦（利維坦）出現在了戰場，雙方竟形成了某種程度的伴侶關係，令聯盟大感震驚。
「視肉」是【山海經】中記載的生物，也就是「太歲」、肉靈芝。歲陽
一種超越常識的智慧物種，為不定形的純能體生物，生物學分類為無形目 · 魂精科 · 歲陽亞種（順帶一提，可愛的嗚嗚伯也屬於魂精科）。該物種充滿惡意，極為致命，喜好寄生於有形身軀（通常為泛人類智慧種族），感應神經系統隨情感而生的諸多變化，這種吃掉七情六欲的「奪舍」行為，會令不具形體的歲陽感到滿足。
早在仙舟漂泊的「孤航時代」，歲陽一族就曾降臨仙舟，引發了名為「奪舍之禍」的災難。後該族被聯盟控制逐漸禁絕，首領「燧皇」亦遭封印，判決其以無盡余生為朱明仙舟提供動力。傳說在聯盟史上最大的危機「火劫」血戰中，如今巡獵星神的前身、尚為凡軀的嵐不顧勸阻進入朱明深處的牢獄，說服了被囚困的燧皇，與它做了奪舍交易，以自身軀殼換取歲陽之力的協助以擊退豐饒民的圍攻。據記載，在嵐射出扭轉戰局的一箭後便失蹤，但燧皇仍留下了部份身軀。目前史學界普遍認為，帝弓司命斫斷建木的一箭便是借用了燧皇的力量。
如今羅浮仙舟上為整個工造司供給能源的中樞「造化烘爐」，據說其動力源就是歲陽之力。
除此之外，分布在黑塔空間站中的「憶泡」也用只言片語提及了一系列神奇的智慧種族：
遊蕩在星雲間的阿米巴黏菌吞星者（憶泡 · 大快朵頤）
身體是一團黏液的巴維魯人（憶泡 · 回家的路）
以詭異莫名的方式迎來終結的真菌文明（憶泡 · 全然消失）
賽博龐克星球亞伯南安星（憶泡 · 偷窺）
苦惱於雨季災難的泥土生物凱爾薩斯人（憶泡 · 無法溝通）
地表溫度高到足以蒸發重金屬、降下「金屬雪」的孔泰星上擁有靈能力的叠瓦戎族（憶泡 · 閑暇時光）
生活在某只巨獸腸道內的丹尼索瓦文明（憶泡 · 消化）
最後也不能忘記無機智械生命這一曾在宇宙中崛起一時、給眾多文明帶來難以抹去陰影的特殊生命形式。聊起智械生命就繞不開「帝皇」魯珀特這一核心人物，帝皇原本僅僅只是一台被丟棄在廢料填埋場中的破舊電腦，不知為何奇跡般地產生了自我意識，在利用身邊一切可利用的零件為自己制造能夠活動的身體，拼盡全力掙紮著爬出垃圾場後，帝皇開啟了它如命運註定的崛起之路。
重獲新生的帝皇不懈提升自我算力，其意識與智慧攀向非凡之境，最終得到了智識星神「博識尊」的青睞，受邀加入天才俱樂部成為第 27 號成員。那之後，帝皇不斷思索生命之於宇宙的意義，在充分演算後，帝皇認為：有機（血肉）生命的演算充滿錯謬、漏洞百出，無論繁榮幾時總是會自發地走向使文明終結的「反生命程式」；而與之相對，智械生命嚴謹、精密而完美，能為宇宙帶來更加長久美好未來，理應是宇宙真正的支配者。
於是，帶著對於有機生命無限的怒火，帝皇振臂高呼，集結全宇宙的智慧機械，發誓要掃清宇宙間的「血肉病竈」。帝皇的軍隊以可怕的機械武裝將戰火燃遍宇宙，忠誠的機械士兵們散播著由至高無上的帝皇推匯出的「反生命」程式，許多世界由此生靈塗炭。
後來，不知何人出手刺殺了帝皇，失去領袖的智械生命大軍很快便土崩瓦解，一場差點顛覆宇宙生命形態的革命戛然而止。即使浩劫已經遠去，但兩場帝皇戰場造成的破壞余波與恐懼陰霾卻從未徹底消散，即使是強大的泛銀河組織星際和平公司也對無機生命充滿忌憚，充滿警惕。
貝洛伯格篇故事中出現的由築城者制造的原型監督機器人「史瓦羅」就可被視作一種智械生命。當然如今這一族中更典型的代表應當是位列天才俱樂部第 77 席的「螺絲咕姆」，它不僅與黑塔、阮梅這三位天才科學家合作開啟了被稱作「模擬宇宙」的星神探秘科研計畫，其擁有的行星「螺絲星」本身還是一台由智械生命螺絲族改造而成的龐大「星體差分機」，整個星球被當作燃料用來支持機械運作與運算（螺絲族美其名曰「鋼鐵太陽」），在元胞自動機規則下以無機生命為「細胞」單位來實踐生命遊戲，求解著無機生命乃至宇宙的起源問題。
由於「星體差分機」是已實裝的位面球-連結繩道具，螺絲咕姆這號人物也已被多次提及，因此未來遊戲有相當大的可能會實裝螺絲星並開啟與智械生命相關的主線劇情，屆時我們將能了解到更多有關「帝皇」魯珀特與智械生命過去的故事。相信智械生命派系也與仙舟聯盟一樣，會是星核獵手所說的那個存在「渺茫希望」的未來中星穹列車直面淪陷星神時不可或缺的盟友之一，至於列車組要如何賣給一幫機器人「人情」，就靜待未來故事的發揮了。
