依次回答題主的兩個問題：
1. 有沒有危害？
如果燙著直接喝下去， 可能有危害。稍微放涼再喝就可以避免。
因為 65 攝氏度以上的熱飲是 WHO 下屬國際癌癥研究機構（IARC）致癌物評級中的 2A 級致癌物 ，也就是說，65 攝氏度以上的熱飲對人體「很可能致癌」。 [1]
為什麽呢？其實很好理解，過燙的飲料直接經過食道喝下去，可能造成食道粘膜損傷。如果有喝燙飲料的習慣，長期這麽喝，那食道粘膜反復的損傷就可能增加癌變的機率。
當然，想證明這一點需要大量的研究數據。研究者在南美針對馬黛茶（Mate）做了一些病例-對照研究，發現那些喜歡喝非常燙（≥65℃）的馬黛茶的人，患食道癌的機率顯著高於那些喜歡喝溫的或者冷的馬黛茶的人。此外，有一些研究選用的是其他飲料，也發現喜歡喝非常燙飲料的人，食道癌發病率會上升。還有一些動物實驗也表現出了類似的結論。 [2]
但科學家認為，目前現有的數據還不夠多，沒辦法證明兩者之間的因果關系。因此 65 攝氏度以上的熱飲目前還是處於 2A 級的「可能致癌」狀態。
這個級別和丙烯醯胺、亞硝酸鹽、油炸食品、紅肉處於同一個分級中。我在之前的文章中已經提到過，對於 2A 類致癌物，我們平時要做到「完全避免」不現實也沒有必要。但如果能夠做到盡量少接觸，不要「長期、大量」攝入的話，那還是能降低風險的。
特別是「別喝太燙的飲料」這一條很容易實作，因此它很適合作為一條健康膳食的建議。
回到題主的問題： 如果牛奶燙著直接喝下去，可能會增加患食道癌的機率。而放涼一些再喝就能規避這個風險。
但題主可能更想知道，高溫過程會不會產生什麽對人體有害的成分。
其實只要時間不要太長（比如一直放好幾天之類的），那就不會產生別的有害成分，可以放心食用。
但如果牛奶在高溫下放時間太長，那我們就有必要考慮一些明顯的化學變化，比如：
只不過學校裏的牛奶一般不會放到那麽長時間，不用過多考慮這種情況。
2. 破壞了營養嗎？
可以肯定的是，只要是經過了熱處理步驟，必然會對牛奶中的營養成分有所破壞。 熱處理時間越長，溫度越高，破壞作用越明顯。
正常的牛奶，不管使用巴氏殺菌還是超高溫滅菌（UHT），殺菌時間短的只有零點幾秒，長的也只有半小時。很多文章說巴氏殺菌奶比常溫奶營養價值高，其實高出的這一丁點營養價值很容易透過其他食物補齊，幾乎可以忽略不計。
而學校如果長時間把牛奶加熱售賣，那時間就要長很多了，營養損失也無法忽略不計了。
營養損失最大的是 蛋白質 和 維生素 。
這裏需要澄清一下，很多人認為牛奶加熱後，蛋白質會變性，因此營養會損失。實際上蛋白質變性本身不意味著營養損失，因為變性的蛋白質還是同樣的胺基酸組成，被消化吸收以後還是一個樣。甚至變性後的蛋白質更容易吸收。比如熟雞蛋就比生雞蛋更好吸收。
但是，長時間高溫可能會引發一些胺基酸的化學反應和分解。比如，賴胺酸就會和牛奶中的乳糖發生美拉德反應變成類黑素，從而損失掉 [3] 。這種損失就是「實實在在」的了。
水溶性維生素會隨著加熱時水分的蒸發被一起帶出。脂溶性維生素雖然不會蒸發，但長時間加熱也容易引起這些物質氧化、分解。長時間加熱的話，維生素的損失率是相對比較大的。
在加熱過程中，礦物質的絕對含量幾乎沒失真失，但目前也有證據顯示，牛奶中的鈣質在長時高溫加熱之後，一部份會轉變成不容易被吸收的形式，因此鈣的吸收效率會降低。 [4]
總之，如果牛奶長期加熱放置，營養成分肯定會破壞一些。加熱時間越短，溫度越低，營養保留越完全。
參考
- ^ IARC Monographs Volume 116: Evaluation of drinking coffee, maté, and very hot beverages https://www.iarc.fr/featured-news/media-centre-iarc-news-mono116/
- ^ Loomis D , Guyton K Z , Grosse Y , et al. Carcinogenicity of drinking coffee, mate, and very hot beverages[J]. Lancet Oncology, 2016, 17(7):877-878.
- ^ a b Borad S G , Kumar A , Singh A K . Effect of processing on nutritive values of milk protein[J]. Critical reviews in food ence and nutrition, 2016.
- ^ Effect of Heat-Treat Methods on the Soluble Calcium Levels in the Commercial Milk Products https://www.researchgate.net/publication/264150403_Effect_of_Heat-Treat_Methods_on_the_Soluble_Calcium_Levels_in_the_Commercial_Milk_Products
