光合作用中有一個關鍵的酶叫RUBP羧化酶，他的作用是讓CO2與1，5-二磷酸核酮糖(C5)加成，生成不穩定的6碳中間產物，最後再分解成3-磷酸甘油酸(C3)。然而，這個酶可能是出現在大氧化時期前的緣故吧，有一天生的bug，就是在氧氣濃度高的時候，會催化C5與氧氣的氧化還原反應，生成有毒物質乙醇酸(C2)，然後再經過粒線體的處理重新轉變為CO2，再重新與RUBP(C5)結合，整個過程不僅沒有產出能量反而還消耗了好多能量。
C3植物，直接躺平，上古程式碼咋都不改。
// TODO: 改變羧化酶的植物，目前沒有，改變意味著光合作用的崩潰，植物個體死亡。
但是，植物界還是有英明的植物/*再拉一坨屎山*/最佳化光合作用過程的。
C4植物，我再加個機器，先預處理一下CO2，在葉肉細胞中CO2與磷酸烯醇式丙酮酸結合生成草酰乙酸在還原成蘋果酸以收集CO2，然後運到維管束鞘細胞分解蘋果酸獲得CO2，直接進入卡爾文迴圈，剩下的部份回到葉肉細胞再生成磷酸烯醇式丙酮酸繼續迴圈(有沒有感覺像屎山程式碼裏的 }}}}}}}}})。然而這套系統折騰下來劇耗能量，所以這也是非熱帶地區很少見C4植物和玉米為什麽要夏天在種的原因。
CAM植物(景天科酸迴圈)，面向C端(荒漠)，環境多變惡劣，用不起多個機子，於是乎直接多執行緒，一個細胞幹了C4兩個細胞的事，只不過白天消耗儲存的CO2，黑夜儲存CO2，有股並行的味了。為了儲存CO2，它們前進演化了富含大量液體的液泡，讓整個植物看起來肉乎乎的，於是有了多肉植物一說。然而這互斥鎖寫的有點亂，行程亂了 (高溫會影響CAM植物的代謝)直接關機重新開機(夏眠)，然後一澆水就爛根。
2022.8.3
然而，IT界有句話：程式能跑就不要改它。生物也將其貫徹到底，低階的海綿就是個例子。
同理，為什麽相對低效C3植物不會自然界淘汰也有自己的原因。
首先要明白第一件事是光合作用會產生大量的NADPH，這樣就會出現一個問題，當葉綠體消耗NADPH遠小於NADPH的產生速度時，NADPH會趨向於與O2結合，產生出毒性很強的超氧化物，雖然葉綠體中超氧化物歧化酶和過氧化氫酶，在一定程度緩解危害，但也架不住由自由基攻擊葉綠體DNA，導致葉綠體關鍵酶(像RUBP的大亞基)的合成受到幹擾，甚至導致葉綠體被細胞分解回收。第二件事是葉綠體中的ATP有一個量，而且葉綠體與外界交換ATP和 ADP/Pi的效率很低，葉綠體以半自主復制的形式消耗ATP更是少見，所以當因光作用產生高濃度氧環境的情況下，往往也是ATP飽和的時候。綜上所述：植物利用光呼吸提高CO2濃度，用卡爾文迴圈消耗ATP和NADPH，實作了過載保護。
但客觀上講，光合作用產生過量ATP/ NADPH實際上就是因為能量轉化效率的低下，從而讓無法轉換的能量破壞光合系統。有人說是光呼吸保護了光合系統。對，這一點沒錯，但同時也是它是屎山的的一個要點，如果使RUBP酶變化，不容易與O2結合，是在一定程度上提高了CO2的轉化率，但要冒著葉綠體被破壞的風險。就像你想處理屎山程式碼，在不細致了解的情況下亂改，最後屎山塌了，計畫崩了，放在生物裏就是滅絕了。如果你還是堅持要改變RUBP酶，那還要考慮幹旱脅迫下，植物在氣孔閉合時，如何保證CO2和水的穩定供應，正如評論中的伊眼攏鼻所說：生物的程式碼之屎，最簡單的體現就是人類試圖用cre語句呼叫某一個程式時，總有莫名其妙的野雞程式也跟著響應。
C4和CAM植物的經典之處就是封裝然後再模組化，把CO2的收集封裝成一個模組，再把CO2的固定(卡爾文迴圈)封裝另成一個模組，放在兩個細胞或者兩個時間段執行，但第一個模組相當耗能，這無異於把屎山分成一塊一塊的，再在裏面精明的拉一泡，最後還是屎山，甚至在一定條件下比C3的效果更差。
因此大多數植物的選擇是直接不改變原有的光合系統。
還有，基因和環境共同決定生物性狀，光合系統的屎山邏輯同時也說明其對應的基因也是屎山。
