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有什么好用的生物医学科研【在线】小工具?

2019-06-10健康

推荐生物医学科研生最值得收藏的几个宝藏—— 视频学习网站,文献网站,处理工具

一、视频学习网站:

1、Osmosis

这是一个非常有趣的视频网站、采用动画模式讲解疾病的发生机制。医学小白必入的宝藏网站。

可以通过Osmosis编制的视频、游戏、互动课件和实验现场来学习医学知识。这些资源都由有能力的学者、医生和教育家编写而成,通过这些资源可以有效地巩固知识点。

2、DNA from the begining

提供DNA、基因、基因组成等方面的在线教程,将遗传学的复杂科学原理变得简单易懂,而且较为生动地教授了DNA的重要性及其对我们的生命的影响。

学习者可以了解DNA的基本结构和功能到生物技术和人类遗传研究,包括DNA如何编码为蛋白质,如何实现基因转录和翻译,以及有关基因突变、人类遗传衰变和药物治疗的最新发现。

3、Cellsalive

Cellsalive网站囊括了细胞的各个层面,包括细胞的结构、功能、分裂等方面的内容。它提供了丰富的图像、动画和视频,以表达细胞结构和功能的复杂性和多样性。特别地,非常适合教师使用该网站的各种资源设计和制作更好的互动教学课程,激发学生对生命科学的热爱和兴趣。

4、Geeky medics

大量的医学课程和培训内容,涵盖了从解剖学、生理学、病理学到药物治疗等各种方面的知识。提供了大量的演示和模拟软件,以帮助医学生和实习医生实践真实临床场景的应用技能。其中包含了虚拟患者。

免费免费,收录内容丰富,主要是临床基础医学知识内容。最大的特点是可以把内容做pdf都打印出来。

5、医学微观

介绍了细菌学、病毒学、寄生虫学以及真菌学等领域的知识,提供了大量的精美图示以便用户更好地理解微生物学中的复杂概念和过程。还提供了病原体的介绍、传播途径、临床表现、预防和治疗等相关知识,是一个非常好的医学微生物学素材库。

二、资讯、文献网站:

PubMed、sciencedirt等这些常用的就不介绍了,一下介绍几个针对生物医学的网站。

1、MedScape

提供了关于医学、健康和医疗新闻及专业资讯、研究报告等广泛的信息,例如医学研究进展、药物信息、临床实践知识等方面的内容,同时还提供疾病诊断和治疗方案、病例研究等领域的信息资源。

是一个非常有价值的医学信息共享平台,帮助医生和医学工作者掌握最新的医学动态和研究成果。

2、PubMedPro

提供了一个非常大的医学文献数据库,包括了近3000多个期刊。包括医学、健康、生物学、工程等多领域的期刊文章。可以快速地搜索、筛选、阅读全文和下载文献的摘要信息。

提供了类似韦恩图等可视化的工具,把医学科研数据、文献和研究成果整理整合成系统性的框架。

三、处理工具

1、生物计算器NEBioCalculator

多功能的在线工具,可用于处理DNA、RNA、蛋白质等生物分子的序列和结构。提供了多种实验工具,包括PCR引物设计、反应体系优化、序列反转、修剪、计算Tm值等。同时也支持限制酶切位点预测、双杂合分析、蛋白质分子量计算等分子生物学实验计算。

2、基因结构可视化工具Exon-lntron Graphic Maker

根据输入的基因序列,自动生成基因的外显子和内含子结构图,可以输入多个基因信息进行比较,也可以调整图形颜色和样式,包括线条、字体和标注等,使基因结构图更加美观易读。

3、基因信息平台Genecard

基于世界各地多个数据库以及多项文献的综合数据,包括百科全书、基因诊断、药物靶点和临床研究等。提供了大量的基因信息,如基因功能、通路信息,物种分布、编码蛋白等,还包括疾病、药物和试剂等基因相关资源。

使用:通过输入基因名称、别名、大体特定的序列信息等,查询到该基因相关的信息、疾病、药物相关信息等等。

4、蛋白互作网络String

对于生物医学研究工作者而言,String成为一个重要的工具,用于鉴定潜在的生物学过程和发现新的药物靶标。目前包括超过2千万个蛋白质及其互作关系,并整合了多种高通量实验技术数据及生物信息学分析,可用于预测蛋白质互作网络,并支持蛋白质复合物、代谢通路等各种生物功能分析。

使用:通过搜索特定蛋白质或者输入一组蛋白质进入该网络,并且系统会自动计算所选蛋白质在网络中的相互作用情况,提供图表等多种方式来展示网络的拓扑结构。

5、引物设计Primer3Plus

这是基因组学或分子生物学实验设计过程中常用的在线引物设计工具。它是基于Primer3算法进行设计引物的软件,但与其它Primer3版本相比,Primer3Plus拥有更友好的界面和更加丰富的功能。

使用:输入序列、基因等相关信息入输入框中,选择适当的引物长度、Tm温度范围、GC含量、目的PCR区域等参数选择(注意不同PCR反应类型都需要不同参数),并选择在输出中需要的其他信息(如引物质量控制、SNP效果预测、温度梯度PCR等)。Primer3Plus会自动计算引物特性参数和可能存在的二聚体和反向互补等问题,并生成最优的一组引物。