有一个新修版改动之后忘了改的地方。不能说是bug，但是第一次看小说的人会感到很费解。
在万安寺，灭绝托孤周芷若，让她发誓去欺骗张无忌，拿到倚天剑和屠龙刀。这一段在连载版里是明确写出来的，但是新修版留了个悬念：
鹿仗客点点头，走出房去，守在门外。等了一会儿，忽想偷听她母女二人说些什么秘密，便运起内功，俯耳门上。但听得唧唧哝哝，一人声音极低，语音沉厚，当是灭绝师太在说话，凝神听了半天，却半个字也听不到。 过了一会儿，只听得周芷若「啊」的一声，说道「师父，弟子年轻，入门未久……你老人家必能脱困……」 鹿仗客大奇：「怎么她叫母亲做‘师父’，不叫‘妈妈’，难道她还不知自己是灭绝老尼的私生女儿吗？」 又听得周芷若不断推辞：「弟子实在不能，弟子做不来，弟子不能……」灭绝师太厉声道：「你不听我的嘱咐，便是欺师灭祖。」一个推托，一个严命，一来一往，说了好久。鹿仗客听不出灭绝师太叫女儿答允什么，周芷若又推辞什么，只听得周芷若呜呜咽咽地哭了好一阵。 鹿仗客这时等得老大不耐烦，打门道：「喂，你们话说完了吗？以后说话的日子长着呢，不用赶着这时候说。」灭绝师太脾气暴躁，粗声喝道：「你啰唆什么？」鹿杖客不想得罪她母女，令得苦头陀不快，便道：「好，好！我不来啰唆，你娘儿俩慢慢说罢。」灭绝师太怒道：「不伦不类！我们是两师徒，什么‘娘儿俩’？」鹿杖客赔笑道：「是，是！」又等了一会儿，心中挂念着韩姬，实在耐不住了，便快步上到第十层乌旺阿普房外。
又过一会，灭绝师太已对周芷若交待了本门的重大事务，只听得有人又在打门。灭绝师太心想：「今日已来不及传功了。」朗声道：「进来吧！」
而灭绝究竟让周芷若做什么，放在最后的该死的「往事依稀」环节。
但是在后边一章，被金花婆婆下毒之后，周芷若的心理状态是：
金花婆婆原本已料到此事，借剑之言也不过是万一的指望，但听周芷若如此说，脸上还是掠过一丝失望的神色，突然间厉声道：「你要保全峨嵋派声名，便保不住自己性命……」说着从怀中取出一枚丸药，说道：「这是断肠裂心的毒药，你吃了下去，我便救人。」周芷若想起师父的嘱咐，柔肠寸断，寻思：「 师父叫我欺骗张公子 ，此事我原本干不了，与其活着受那无穷折磨，还不如就此一死，一了百了，甚么都不管的干净。」当下颤抖着接过毒药。静玄喝道：「周师妹，不能吃！
这里一句「师父叫我欺骗张公子」，有点莫名其妙，不知从何而来。
看过以前版本的观众自然之道，没看过的观众，会感觉这种缺乏铺垫的写法和突兀，很糙，或许是金庸忘了改了。
还有一些不合理的地方，是连载版到修改版的时候遗留问题。
例如我小时候不知道为啥，一直以为周芷若是常遇春保护的小孩，周子旺的后代。后来仔细看了，才发现她就是一个船夫的女儿，这么巧，也姓周？
但是在连载版中，她确实是周子旺的女儿，常遇春救出她和哥哥，但是哥哥被杀了。
也许金庸的考虑是灭绝如此痛恨魔教，可能无法接受周芷若。但这种改动却带来一个不合理的地方：
张三丰为何如此轻松就让常遇春带张无忌去了蝴蝶谷？
连载版里是这么说的：
常遇春昂然道：「张真人可把咱们明教中人，忒也瞧得小。」 他转头向周芷若道：「周姑娘，你暂且跟张真人去，好不好？」 周芷若尚未回答，张三丰愕然道：「什么？」常遇春：「张真人不愿去见我胡师伯，这个是我知道的，自来邪正不并立，张真人是当今大宗师，如何能去相求于邪魔外道？我胡师伯脾气古怪，若是见到张真人，说不定礼貌不周，双方反而弄僵。 这位张兄弟只好由我带去，但张真人又未免不放心。是以我请周姑娘到武当山暂住，待张兄弟身子安好了，我送他上山，再来接周姑娘回去。打开天窗说亮话，那便是将周姑娘作抵押。 」张三丰一生和人相交，肝胆相照，自来信人不疑，可是张无忌是他爱徒唯一的骨血，要他交在以诡怪邪恶出名的魔教弟子手中，确是万分的放心不下。
张三丰一时踌躇未答，常遇春又道：「咱们周子旺大哥仁义过人，在信阳举事失败，满门二十三口，全死于鞑子之手，连周大哥七十八岁的老母，也是难免一刀。 小人拚了性命，抢着他一子一女出来，岂知小公子又中鞑子的毒箭身亡。这位姑娘是周大哥在世上独一无二的亲骨肉 ，周大哥身在明教，仇敌遍于天下，不但鞑子要追捕他女儿，他无数强仇若是知道讯息，非跟你张真人找麻烦不可。张真人，武当派虽然威震天下，但你还得小心。」
张三丰心下不禁哑然失笑，自己尚未答允收留周芷若，这个直心肠的汉子却已在谆谆叮嘱起来，要跟周芷若为难的人固多，江湖上要捉拿张无忌来加以逼问的人又岂是少了？只是无忌眼下毒入膏肓，当真「左右也是个死」，多大的凶险也顾不得了。他也无法多想，便道：「 遇春，咱们一言为定，我替你好好照顾周姑娘，你替我好好照顾无忌。 待他体内阴毒去尽，便请你同他上武当山来。」常遇春道：「受人之托，忠人之事，小人必当全力而为。」
所以说，周芷若其实是一个「质子」，张三丰之所以放心让常遇春带走张无忌，是因为常遇春旧主的唯一后代在他手上。
而如果把周芷若改成普通的船夫女儿，这个「质子」的作用就不存在了，她对常遇春来说是无关紧要的。
这样，张三丰放张无忌跟常遇春走，就显得有点不合常理，毕竟「张无忌是他爱徒唯一的骨血，要他交在以诡怪邪恶出名的魔教弟子手中，确是万分的放心不下」。
