长海是有鱼的，只是游人视鱼看不到而已，以及因为气地形等环境导致这里比九寨沟的其他海子更加缺乏食物资源和躲避空间，所以鱼的数量也比其他海子要少不少。
长海的的鱼类有且只有嘉陵裸裂尻鱼Schizopygopsis kialingensis一种，这是一种典型的高原鱼类，稀有而又神秘。栖息于高山溪流,以底栖无脊椎动物为主食,亦食着生藻类。56月为产卵盛期。该物种的模式产地在嘉陵江，是我国的特有物种。主要分布在嘉陵江上游支流白龙江（尤其是九寨沟），在产地俗名叫「小白飘」、「冷水鱼」、「林叶子」等。它虽然不是九寨沟的特有物种，但在九寨沟以外的其他地区，却很难看到像九寨沟一样的单一的种群和丰富的种群数量，而且从沟口到长海的不同海拔均有分布。它所在的裂腹鱼亚科（Schizothracinae）鱼类是青藏高原鱼类的重要类群之一。它们对高原环境表现出了很强的适应性，成为在高原上分布范围最广、分布海拔最高的类群，最高可分布到海拔 5600m，是鲤科鱼类中适应高寒环境的一个特化类群，它和鳅科高原鳅属鱼类共同构成了青藏高原鱼类区系的主体。繁殖期在每年 6 月河流解冻之后，产卵场位于水深 1 米以内的缓流处。近年来，随着自然地理气候的变迁、人类活动的加剧，涉水工程的建设、水体污染和长期过度捕捞等对嘉陵裸裂尻鱼产卵场、索饵场、越冬场和洄游通道（简称「三场一通道」）等造成了严重影响，再加上其性成熟晚，分布区域狭窄，生长速度缓慢等自身因素限制了种群的发展，种群数量急剧减少，栖息地呈现出一种破碎化状态，故已被列入甘肃省重点保护野生动物名录。
图片摄于九寨沟五花海
