勉強回答一下：
嚴格來說，Pokemon世界觀中一直都有「退化」這個設定，主系列遊戲中存在（僅有設定），旁支中存在，動畫和桌面卡牌遊戲中都存在，只是你在主系列遊戲中幾乎不可能實作而已 。退化這個事情其實遊戲也好，動畫也好都是一直不避諱的東西，設定貫穿始終。
主系列遊戲中的「退化設定」：椰蛋樹&呆呆獸，僅存設定無法實作
在主系列遊戲中，「退化」設定存在，但是僅僅作為「設定」存在，玩家是無法透過遊戲內的操作實作「退化」的。 比如，在椰蛋樹的圖鑒中，專門提到了「其中一個頭長大後掉落到地面就會變成蛋蛋」這種情況 。而且在多個世代中出現：
掉下來的頭會作為蛋蛋， 為了尋找夥伴而開始發出特殊的心靈感應。——【寶可夢：銀】
被稱為會走路的熱帶雨林。 其中一個頭長大後掉落到地面就會變成蛋蛋。——【寶可夢：黑白】
被稱為會走路的熱帶雨林。 其中一個頭長大後掉落到地面就會變成蛋蛋。——【寶可夢：Y】
這個就不一一列舉了，上述二世代、五世代、六世代的圖鑒說明僅僅是個例子，實際上每一世代的圖鑒中都會涉及到椰蛋樹的這個「退化過程」，只是這個更像是世代繁衍的過程。 不過，你即使覺得這是繁殖而不是退化，那麽還有一個更為典型的退化設定——呆呆獸/呆河馬：
又如，在呆河馬（呆殼獸）的圖鑒中，會提及尾巴上的大舌貝脫落之後，就會變回呆呆獸 。眾所周知，呆呆獸的前進演化過程是大舌貝咬住尾巴，然後前進演化為呆河馬，反之亦然；大舌貝從尾巴上脫落，就會「退化」為呆呆獸。
這個「設定」至少是從初代開始，直到八世代依然適用，而且是寶可夢圖鑒中的官方說法，隨便舉幾個例子：
在海邊悠閑地生活。 如果尾巴上的大舌貝脫落了，它就會變回呆呆獸。——【寶可夢：皮卡丘】（黃版）
基本上一直在發呆。 當尾巴被切斷，大舌貝脫落後，它就會變回呆呆獸。——【寶可夢：究極太陽】
因為被大舌貝咬住而受到的刺激使它變得能夠兩足直立行走。 當大舌貝離開後，它似乎就會變回呆呆獸。——【寶可夢：盾】
可以說，到目前為止，官方已經緊緊將大舌貝和呆呆獸兩個的「伴侶關係」聯系在一起了，成也大舌貝，敗也大舌貝……
這些僅作為描述存在，無法在遊戲中實作，但是嚴格來講「退化」的設定客觀存在 ，主系列遊戲中的主要問題是你根本沒法「實作」退化的過程。主系列遊戲中前進演化後除非生蛋，不然本體不會發生這類變化，即使在號稱比較「寫實」的幾代作品中，依舊沒有這樣的場面出現……
動畫中的「銀伴戰獸-內容空」和時光倒流現象
動畫中「退化過程」可就真正出現過不少次了，一個比較典型的案例是「大舅哥」格拉吉歐的「內容：空」，從銀伴戰獸和內容空的形態中「切換」，但是內容空某種意義上本身就算是「人造物」似乎並不能代表自然界的常態……
此外，動畫中專門刻畫過在時空「紊亂」狀態下的情況，比如平行時空的神奧地區就出現過「神仙打架」，造成寶可夢的「集體退化」（主要是時光倒流）的情況出現，有些寶可夢退化為前進演化之前的形態，有些寶可夢直接「變蛋」……
然而，其實這種情況下，就有點「可遇而不可求」了，動畫中確實出現了幾次這種特殊情況下的退化情況，但是並不是一般常態……
然而，從設定上講，退化是存在的，只是不普遍， 而真正意義上「泛濫」的退化情況下主要出現在各類旁支遊戲和卡牌遊戲。旁支遊戲不多說，從主機端的【救助隊】系列到手機端的【大集結】都有隨意進退化的情況出現，這裏重點說一下官方程式度較高的集換式卡牌：
集換式卡牌：退化機制是常態，有「退化道具」和「退化技能」
至於一起打牌的小夥伴們，我就可以直接說了，「讓對手的寶可夢退化」是一種PTCG（寶可夢集換式卡牌）中的策略和戰術，而且不算很「罕見」。在官方卡牌之中，專門設計了一些用於「退化」的道具——「退化噴霧」，形象上比較固定，而且多個卡包、系列中均存在。
退化道具也就算了，很多寶可夢內建諸如「退化光線」這種技能……能夠直接或者間接達成「退化」或者「類似退化效果」的技能數不勝數，不限於夢幻，如果我沒記錯雪拉比等卡牌均有這種效果，是一類常見情況
所以，綜上所述，退化的設定一直存在，而且除主系列遊戲外，很多都能實作， 動畫中也出現過，雖然不常見。 但是，更多的時候僅以「設定」出現 ，大多數時候，還是以主系列遊戲設定為骨架，並不刻意表現退化過程。
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