荷魯斯叛亂前：
機械神教與泰拉透過【奧林匹亞條約】結盟，可以保持歐姆尼賽亞的信仰而不受帝國真理（無神論）的約束，從而以帝皇為紐帶（認為帝皇是歐姆尼賽亞的化身）與泰拉構成一個二元帝國。帝皇向火星提供了導航者和星語者以使得火星重新具備亞空間航行能力，作為交換護教軍和泰坦軍團作為泰拉的盟軍參加了大遠征。雖然機械神教此時可視為一個獨立的勢力，但實際上很多基因原體都在私下滲透機械神教以獲取一些特別的技術支持，例如白色傷疤的戰艦有遠超標準版本的速度，Alpha軍團秘密地從鑄造世界獲取非標準stc的特種裝備等。
荷魯斯叛亂期間：
機械教爆發了內戰，史稱「二元分裂」，支持荷魯斯的派系認為帝皇只是在榨取機械教的生產能力。叛亂派系首領卡爾博哈爾在火星地底用荷魯斯提供的金鑰開啟了莫拉維克地窖。莫拉維克地窖在火星與泰拉結盟時被帝皇封印，其中包含了人工智能和亞空間機械等禁忌技術，開啟地窖的行為產生了波及火星全球網絡的廢程式碼汙染。在接下來的火星內戰中忠誠派落敗並隨帝國之拳的救援部隊撤退到泰拉，之後參加了網道戰爭和最後的太陽戰爭以及皇宮保衛戰。荷魯斯叛亂期間其他星域的忠誠鑄造世界因為懷言者掀起的亞空間風暴與泰拉失去了聯系，所以在事實上效忠於距離最近的帝國領導人物，例如第二帝國（五百世界）所屬的鑄造世界主要向極限戰士軍團基因原體基裏曼提供支持。在荷魯斯死後忠誠派奪回了火星，卡爾博哈爾失蹤，其追隨者逃入了恐懼之眼成為了黑機械教。
荷魯斯叛亂後：
機械教同其他帝國勢力一起接受了改革，改革後的機械神教失去了自己的獨立地位，與泰拉政府、國教會成為平級機構，主要負責整個帝國的工業生產及技術研發工作。此時的機械神教接受泰拉最高議會領導，但是在泰拉議會中火星鑄造將軍（機械教最高首領）享有一個固定席位，如下圖：
不過由於機械教內部特有的信仰組織體系使得外部插手的難度很大，強大的生產能力也使得其擁有遠超國教的軍力，所以機械教運作的自主性仍然很強。許多鑄造世界除了交付泰拉政府的訂單、在帝國軍事機構提供技術支持外，仍然有自己的探索/軍事行動。同時一些行商浪人，星際戰士戰團也透過發現技術遺跡、stc碎片的方式與機械教進行非官方的私下交易以獲取產品。鋼鐵之手戰團因為其獨特文化（認為血肉軟弱、鋼鐵不朽而進行賽博化改造）與機械教建立了特殊的親密關系。
基裏曼蘇醒之後：
在30k時期貝利撒留考爾就接受了基裏曼的任務對星際戰士進行進一步最佳化，這一工作在基裏曼進入休眠後也未停止。在十三次黑色遠征期間，貝利撒留考爾發現了黑石尖塔的實際作用並在基裏曼復活中起到了關鍵作用。在基裏曼返回泰拉加冕攝政王之後，基裏曼大幅提升了貝利撒留考爾在火星中的地位，盡管火星上還有很多牧師對貝利撒留考爾的技術異端傾向表示憤怒，但是在基裏曼對考爾的支持下機械教也開始基於貝利撒留考爾的成果大規模生產原鑄星際戰士以及配套的全新武器裝備以支持基裏曼發起的不屈遠征。
貝利撒留考爾向基裏曼提供了一個叫做「劣化考爾」的器材，這個器材可以以遠超帝國星語系統的水平保證基裏曼與考爾的通訊，同時還可以自主交流。盡管劣化考爾自稱只是一個記錄了考爾全部思想的數據庫，但基裏曼認為這個器材其實就是人工智能，同時基裏曼還註意到這個器材在運作時存在靈能反應，而且其上存在很多異端甚至異形技術的痕跡。劣化考爾多次告訴基裏曼貝利撒留考爾請求基裏曼任命考爾為火星鑄造將軍，基裏曼對此表示拒絕，但當菲利克斯（首批原鑄星際戰士，基裏曼復活後任命的四英傑之一）告訴考爾他的請求已經激怒了原體時，考爾本人表示他從未提過這個要求。劣化考爾假傳通訊的行為（智械危機？亞空間汙染？異形陰謀？）可能在泰拉與火星之間埋下了一顆危險種子，在之後釀成新的危機。
