勉强回答一下：
严格来说，Pokemon世界观中一直都有「退化」这个设定，主系列游戏中存在（仅有设定），旁支中存在，动画和桌面卡牌游戏中都存在，只是你在主系列游戏中几乎不可能实现而已 。退化这个事情其实游戏也好，动画也好都是一直不避讳的东西，设定贯穿始终。
主系列游戏中的「退化设定」：椰蛋树&呆呆兽，仅存设定无法实现
在主系列游戏中，「退化」设定存在，但是仅仅作为「设定」存在，玩家是无法通过游戏内的操作实现「退化」的。 比如，在椰蛋树的图鉴中，专门提到了「其中一个头长大后掉落到地面就会变成蛋蛋」这种情况 。而且在多个世代中出现：
掉下来的头会作为蛋蛋， 为了寻找伙伴而开始发出特殊的心灵感应。——【宝可梦：银】
被称为会走路的热带雨林。 其中一个头长大后掉落到地面就会变成蛋蛋。——【宝可梦：黑白】
被称为会走路的热带雨林。 其中一个头长大后掉落到地面就会变成蛋蛋。——【宝可梦：Y】
这个就不一一列举了，上述二世代、五世代、六世代的图鉴说明仅仅是个例子，实际上每一世代的图鉴中都会涉及到椰蛋树的这个「退化过程」，只是这个更像是世代繁衍的过程。 不过，你即使觉得这是繁殖而不是退化，那么还有一个更为典型的退化设定——呆呆兽/呆河马：
又如，在呆河马（呆壳兽）的图鉴中，会提及尾巴上的大舌贝脱落之后，就会变回呆呆兽 。众所周知，呆呆兽的进化过程是大舌贝咬住尾巴，然后进化为呆河马，反之亦然；大舌贝从尾巴上脱落，就会「退化」为呆呆兽。
这个「设定」至少是从初代开始，直到八世代依然适用，而且是宝可梦图鉴中的官方说法，随便举几个例子：
在海边悠闲地生活。 如果尾巴上的大舌贝脱落了，它就会变回呆呆兽。——【宝可梦：皮卡丘】（黄版）
基本上一直在发呆。 当尾巴被切断，大舌贝脱落后，它就会变回呆呆兽。——【宝可梦：究极太阳】
因为被大舌贝咬住而受到的刺激使它变得能够两足直立行走。 当大舌贝离开后，它似乎就会变回呆呆兽。——【宝可梦：盾】
可以说，到目前为止，官方已经紧紧将大舌贝和呆呆兽两个的「共生关系」联系在一起了，成也大舌贝，败也大舌贝……
这些仅作为描述存在，无法在游戏中实现，但是严格来讲「退化」的设定客观存在 ，主系列游戏中的主要问题是你根本没法「实现」退化的过程。主系列游戏中进化后除非生蛋，不然本体不会发生这类变化，即使在号称比较「写实」的几代作品中，依旧没有这样的场面出现……
动画中的「银伴战兽-属性空」和时光倒流现象
动画中「退化过程」可就真正出现过不少次了，一个比较典型的案例是「大舅哥」格拉吉欧的「属性：空」，从银伴战兽和属性空的形态中「切换」，但是属性空某种意义上本身就算是「人造物」似乎并不能代表自然界的常态……
此外，动画中专门刻画过在时空「紊乱」状态下的情况，比如平行时空的神奥地区就出现过「神仙打架」，造成宝可梦的「集体退化」（主要是时光倒流）的情况出现，有些宝可梦退化为进化之前的形态，有些宝可梦直接「变蛋」……
然而，其实这种情况下，就有点「可遇而不可求」了，动画中确实出现了几次这种特殊情况下的退化情况，但是并不是一般常态……
然而，从设定上讲，退化是存在的，只是不普遍， 而真正意义上「泛滥」的退化情况下主要出现在各类旁支游戏和卡牌游戏。旁支游戏不多说，从主机端的【救助队】系列到手机端的【大集结】都有随意进退化的情况出现，这里重点说一下官方程度较高的集换式卡牌：
集换式卡牌：退化机制是常态，有「退化道具」和「退化技能」
至于一起打牌的小伙伴们，我就可以直接说了，「让对手的宝可梦退化」是一种PTCG（宝可梦集换式卡牌）中的策略和战术，而且不算很「罕见」。在官方卡牌之中，专门设计了一些用于「退化」的道具——「退化喷雾」，形象上比较固定，而且多个卡包、系列中均存在。
退化道具也就算了，很多宝可梦自带诸如「退化光线」这种技能……能够直接或者间接达成「退化」或者「类似退化效果」的技能数不胜数，不限于梦幻，如果我没记错雪拉比等卡牌均有这种效果，是一类常见情况
所以，综上所述，退化的设定一直存在，而且除主系列游戏外，很多都能实现， 动画中也出现过，虽然不常见。 但是，更多的时候仅以「设定」出现 ，大多数时候，还是以主系列游戏设定为骨架，并不刻意表现退化过程。
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