我觉得主要是两个方面：一是莫甘娜本身定位独特，二是莫甘娜手里有几个大家特别担心的技能。
先说英雄定位的问题。我之前在这个回答（为什么【英雄联盟】硬辅难度不如软辅，但大家觉得软辅混，硬辅靠实力？）里提到过，简单地使用「硬辅/软辅」这套标准来区分辅助英雄是漏洞很大的，而这里我们要讨论的莫甘娜，刚好就是一个现成的例子。
莫甘娜这个英雄，你如果说她是软辅吧，她的生命成长比旁边的索拉卡、娜美等英雄都高了一大截，护盾技能比隔壁的泰坦还硬，有一手硬控也能开团，而且出装也不是软辅流行的香炉和流水法杖那套；然而，你如果说她是硬辅吧，她的坦度和日女芮尔英雄这种简直毫无可比性，自身缺乏进场技能，开团过于依赖闪现和金身，这些都不像是硬辅英雄该有的样子。
因此，莫甘娜成为了 硬辅里最软而软辅里最硬 的一种特殊存在，而身兼双职也就意味着她会招来更多的针对，就比如说——
所以问题的关键就很明显了，莫甘娜本身既是软辅又是硬辅，既是先手开团型英雄又是护阵反打型英雄，这就导致讨厌硬辅、软辅、先手英雄和后手英雄的玩家群体，都会对ban掉莫甘娜青睐有加，也因此抬高了她的ban率。
反过来说，另有一部分英雄常上ban位的原因是，他们有一个针对性过强的技能。就比如说——
所以大家看出来了吗，有一个「变态技能」的英雄基本上都是ban位上的常客了，而我们题目里的莫甘娜呢，她身上大概有2.5个这种级别的技能——Q技能暗之禁锢，全游戏控制时间最长的小技能，虽说视觉效果上没有机器人那么可怕，但那坨黑黢黢的飞行物也是多少玩家无穷的梦魇；E技能黑暗之盾，全游戏独一份的技能护盾效果，隔壁希维尔、魔腾、女妖和夜刃的效果都是只能挡住一个技能，而且还只能用于自保，远不如莫甘娜E技能泛用性强；R技能灵魂镣铐是剩下的那0.5个变态技能，虽说技能本身的限制很多，而且效果也并不稳定，但你永远不要低估一个群体晕眩技能的上限。
