你做的一点问题都没有。
你父亲虽然没有被告知具体诊断和预后（这个是我国传统文化的原因），但是已经知道是一个预后不良的重病，与实际情况是相符的。在此认知下给了只做临终关怀治疗的指示，医学伦理上讲这叫advanced directive。
这种情况实际上你是必须遵照他的指示去做的，其实不仅是你，医生也必须遵照他的指示去做。咱们国家因为传统观念的原因，患者丧失做医疗决策能力之后基本都是家属在做决策，哪怕家属的决策违背了患者本人之前的意愿，鉴于患者已经丧失决策能力，医生也多是听家属的（因为不听的话找事的是家属，已经昏迷的患者又不会找事）。
但是在医学伦理法规相对更健全的发达国家，患者的临终意愿是医生要无条件遵守的，哪怕家属不接受。并且医生并没有听家属意见的义务。极端的情况是患者本人都不愿意把诊断和治疗决策告知家属，那家属只能干瞪眼，连知情的权利都没有，更别提干涉了。
在你的这个事例里，你父亲给了advanced directive给你，实际上算是把你设定为了他自己丧失决策能力后的决策委托人，并且已经清晰的给了你指示。你按照他的委托做了决策，没有任何问题；你要不按他说的做，比如给予积极抢救、呼吸机、放化疗，那才是违法行为。（在中国这么干的其实有很多，而且也并不会被追究法律责任，实际上这算执法不严，当然这里有文化的原因）。
所以不要给自己无名的压力，你做的很对。
对于死前痛苦这事，只能说我们临终关怀中镇痛治疗还有提升的空间。这不是你的过错，别想太多。
