很簡單，因為銀河裏的大勢力「星際和平公司」把星核獵手當成反派。
「反派」這個概念一直都只是相對的。兩方有強烈的利益沖突，才會對立。那彼此就互為「反派」。
仙舟的閱讀物中，有一份【大敵名錄】：
可以看得出來，仙舟人是把反物質軍團和豐饒民當成「大敵」的。大部份仙舟人的認知裏，豐饒民還有藥師，就是他們眼中的「反派」。
各方勢力的利益不同，所以他們對待某個特定勢力的態度也會不一樣。那我們來看看，有多少勢力會真的把星核獵手當成「反派」呢？
列車組 ：
雖然劇情中各種明示暗示了星核獵手會在旅途中一直「陪伴」列車組。但是單從列車組的角度來講，星核獵手也只是「公司的通緝犯」。
爺其實算是連線列車和星核獵手的紐帶，列車組和星核獵手產生大量交集，也基本都是從爺上車之後。
列車組對待星核獵手一直是一種「謹慎提防」的態度。雖然得防著，但是列車組最後聽了卡芙卡的話還是去了羅浮。也沒有去找公司舉報說發現星核獵手了。列車組對星核獵手可能更多的是「私人恩怨」
不過這件事情，其實當事人也沒啥意見。
老楊和姬子肯定都已經看出來了，星核獵手其實並不會害列車組，尤其不會害爺。但是他們的出現往往預示著事情會比較危險，不得不警惕起來。
列車組和星核獵手，就是兩股交織的命運，你作為其中一方，發現另一方也出現的時候，你就知道：進主線了。
仙舟 ：
實際上仙舟針對的並不是星核獵手，而是刃。刃是實打實的仙舟重犯。而卡芙卡則是因為出現的時機問題，成了仙舟的懷疑物件，所以才通緝並且把她抓了。結果後來發現，卡芙卡在整個羅浮的事件中竟然是鐵好人，所以就又把她給放了。說明仙舟還是很明事理的，你幫了羅浮，那我們也不能卸磨殺驢。不過一方面，她和刃是同夥，另一方面，刃和卡芙卡都是公司的通緝犯，仙舟不能不給公司面子。所以明面上態度還是不太好。仙舟不可能真的在乎公司的通緝令，他們不會去費心抓其他人，抓到了刃也只會自己去處理。相比於仙舟真正的「大敵」，星核獵手，他們真不在乎。
空間站 ：
對於空間站來說，星核獵手確實造成了相當程度的破壞，畢竟星核獵手的行為，一方面造成了裂界，引來了反物質軍團，導致空間站多人犧牲；另一方面，這本身也是對黑塔的挑釁。但是黑塔本人卻相對來說更在乎所謂「勝負」。當然，這主要是因為黑塔是個幼稚小鬼（笑
在1.4過完活動劇情之後，你可以從史瓦羅那裏得到一封螺絲咕姆的信，信中螺絲咕姆稱銀狼為「舊友」。
看得出來螺絲咕姆對銀狼態度還不錯，當然螺絲咕姆本人就非常紳士，對大部份人態度都很好。銀狼雖然確實多次「挑釁」螺絲咕姆，但是可能螺絲咕姆看來，她和黑塔一樣都是幼稚小鬼（笑
家族 ：
雖然，1.6前瞻的時候，星期日說的好像是給星核獵手發了邀請，但是劇情裏沒有明說到底是咋來的。這個還不好判斷。
不過你在夢境販售店裏能得到一點相關資訊，對話中你可以選擇給愛德華醫生講自己的夢，其中有一個關於星核獵手的夢，但是講到一半就會被愛德華打斷。
考慮到匹諾康尼和公司的藕斷絲連，我覺得這裏可能也是受公司的影響。
公司 ：
終於聊到公司了，星核獵手的懸賞令是公司發的，而公司應該也是憑借自己強大的勢力和宣傳能力，讓星核獵手成了宇宙聞名的反派勢力。
先看看公司視角下，星核獵手都幹了些啥：
當然這個比較籠統，詳細一點的過程在千星遊記裏
很有意思的一點是，耶佩拉兄弟會提到的幾個事件中，阿圖因、因奴庇斯都只是「懷疑」和星核獵手有關，而後面提到的高爾康達，則在這個通緝令裏完全沒有出現。實際上那是泯滅幫自己幹的。這個千星遊記裏的「審判」，其實是泯滅幫在利用星核獵手給自己洗白，把鍋都甩給星核獵手。咱不知道你一個淪陷勢力為啥要給自己洗白，你不應該到處破壞然後都攬到自己頭上嗎？也難怪納努克看不上你們。不過無所謂，反正耶佩拉兄弟會已經沒了。
不過還是有一些事件是我們確實知道的，比如針對黑塔的黑客襲擊，針對螺絲星的黑客襲擊，還有最對庇爾波因特的黑客襲擊。（怎麽全是銀狼幹的）
黑塔的襲擊事件我們是親歷者。銀狼黑掉了空間站的防衛系統，然後引來了小股反物質軍團，包括一個末日獸。
星核獵手做這些的目的是為了拿到黑塔手中那個還未啟動的星核，然後把它植入到爺的體內，並讓爺被星穹列車撿到，然後上車。但是整個過程造成了空間站的受損以及人員的傷亡。
我們從這件事可以看出來，星核獵手在某種程度上是有些「不擇手段」的。為了導向他們希望的結局，他們會毫不猶豫地犧牲掉一些無辜者。但是另一方面，我們並不清楚伊利歐看到的所有劇本，也許星核獵手的所作所為，實際上已經是損失最少的劇本了。如果他們不這麽做，或許損失會更大？
所以你從自己的視角，並不能分清楚他們是否真的是「反派」。因為立場不同。星核獵手要把事情導向劇本。這是他們的最終目的，也許他們的目的是好的，但我們終究還是不知道他們的目的到底是什麽。在這個過程中，他們的手段必然會產生一些損失。這些可能在伊利歐看來，都是引導結局的過程中的「必要的犧牲」。
這種「必要的犧牲」，可能在實際上讓公司收到了巨大的損失。公司也是在對星核開展研究的。難免會產生各種沖突，而星核獵手顯然不會在乎公司的利益。他們參與過的事件，可能大都對公司造成了損害。你看卡芙卡光在pv裏就殺了多少公司的人。這些行動可能都直接或者間接損害了公司的利益。而且星核獵手的手段又不那麽光彩，多半是黑客、暴力、心控這種手段。所以給了公司正當的理由去譴責他們，去通緝他們。公司作為壟斷經濟體，資本的化身，星核獵手讓他們一直遭受損失，那公司一定會想辦法出掉他們。
不過這些都只是表面上的原因，實際的原因早就明明白白告訴你了。
星核獵手在智柯瑞的資訊：
公司眼饞伊利歐啊。這種能力誰不想要呢？盡管有超算，有憶庭，宇宙中能預知未來的東西很多，但是如伊利歐這般精確到分鐘的能力，還是令人驚訝。
這種強大的能力，公司怎麽可能不想把它據為己有？想想公司對查德威克做了什麽。
卡芙卡、刃、銀狼、山姆，他們對公司來說太過危險，雖然他們每一個都身懷絕技，但是收服他們風險太高，而且也並不是完全不可替代。但是伊利歐太獨特了，公司很想要，想要抓來研究，想要獲得伊利歐的能力。
總結一下吧，星核獵手為什麽被當做反派：
最根本的原因：公司覬覦伊利歐預知未來的能力。
而星核獵手行事風格不那麽「正當」，成員的能力也的確非常危險。同時星核獵手也的確給公司造成了損失，給了公司通緝他們的理由。而星核獵手信仰成謎，並不知道他們背靠什麽勢力。
公司用自己強大的勢力，把星核獵手宣傳成為宇宙中最危險的通緝犯。成了宇宙中大部份勢力嚴重的「反派」。
這套路是不是挺眼熟的？
你就把公司想成美帝，美帝想要幹啥事情的時候，總歸是為了什麽利益，然後找個理由，打一個冠冕堂皇的旗號，然後再使勁宣傳讓大家都來幫自己。
聯想一下現實，是不是就好理解多了？
