光合作用中有一个关键的酶叫RUBP羧化酶，他的作用是让CO2与1，5-二磷酸核酮糖(C5)加成，生成不稳定的6碳中间产物，最后再分解成3-磷酸甘油酸(C3)。然而，这个酶可能是出现在大氧化时期前的缘故吧，有一天生的bug，就是在氧气浓度高的时候，会催化C5与氧气的氧化还原反应，生成有毒物质乙醇酸(C2)，然后再经过线粒体的处理重新转变为CO2，再重新与RUBP(C5)结合，整个过程不仅没有产出能量反而还消耗了好多能量。
C3植物，直接躺平，上古代码咋都不改。
// TODO: 改变羧化酶的植物，目前没有，改变意味着光合作用的崩溃，植物个体死亡。
但是，植物界还是有英明的植物/*再拉一坨屎山*/优化光合作用过程的。
C4植物，我再加个机器，先预处理一下CO2，在叶肉细胞中CO2与磷酸烯醇式丙酮酸结合生成草酰乙酸在还原成苹果酸以收集CO2，然后运到维管束鞘细胞分解苹果酸获得CO2，直接进入卡尔文循环，剩下的部分回到叶肉细胞再生成磷酸烯醇式丙酮酸继续循环(有没有感觉像屎山代码里的 }}}}}}}}})。然而这套系统折腾下来剧耗能量，所以这也是非热带地区很少见C4植物和玉米为什么要夏天在种的原因。
CAM植物(景天科酸循环)，面向C端(荒漠)，环境多变恶劣，用不起多个机子，于是乎直接多线程，一个细胞干了C4两个细胞的事，只不过白天消耗储存的CO2，黑夜储存CO2，有股并发的味了。为了储存CO2，它们进化了富含大量液体的液泡，让整个植物看起来肉乎乎的，于是有了多肉植物一说。然而这互斥锁写的有点乱，进程乱了 (高温会影响CAM植物的代谢)直接关机重启(夏眠)，然后一浇水就烂根。
2022.8.3
然而，IT界有句话：程序能跑就不要改它。生物也将其贯彻到底，低级的海绵就是个例子。
同理，为什么相对低效C3植物不会自然界淘汰也有自己的原因。
首先要明白第一件事是光合作用会产生大量的NADPH，这样就会出现一个问题，当叶绿体消耗NADPH远小于NADPH的产生速度时，NADPH会趋向于与O2结合，产生出毒性很强的超氧化物，虽然叶绿体中超氧化物歧化酶和过氧化氢酶，在一定程度缓解危害，但也架不住由自由基攻击叶绿体DNA，导致叶绿体关键酶(像RUBP的大亚基)的合成受到干扰，甚至导致叶绿体被细胞分解回收。第二件事是叶绿体中的ATP有一个量，而且叶绿体与外界交换ATP和 ADP/Pi的效率很低，叶绿体以半自主复制的形式消耗ATP更是少见，所以当因光作用产生高浓度氧环境的情况下，往往也是ATP饱和的时候。综上所述：植物利用光呼吸提高CO2浓度，用卡尔文循环消耗ATP和NADPH，实现了过载保护。
但客观上讲，光合作用产生过量ATP/ NADPH实际上就是因为能量转化效率的低下，从而让无法转换的能量破坏光合系统。有人说是光呼吸保护了光合系统。对，这一点没错，但同时也是它是屎山的的一个要点，如果使RUBP酶变化，不容易与O2结合，是在一定程度上提高了CO2的转化率，但要冒着叶绿体被破坏的风险。就像你想处理屎山代码，在不细致了解的情况下乱改，最后屎山塌了，项目崩了，放在生物里就是灭绝了。如果你还是坚持要改变RUBP酶，那还要考虑干旱胁迫下，植物在气孔闭合时，如何保证CO2和水的稳定供应，正如评论中的伊眼拢鼻所说：生物的代码之屎，最简单的体现就是人类试图用cre语句调用某一个程序时，总有莫名其妙的野鸡程序也跟着响应。
C4和CAM植物的经典之处就是封装然后再模块化，把CO2的收集封装成一个模块，再把CO2的固定(卡尔文循环)封装另成一个模块，放在两个细胞或者两个时间段运行，但第一个模块相当耗能，这无异于把屎山分成一块一块的，再在里面精明的拉一泡，最后还是屎山，甚至在一定条件下比C3的效果更差。
因此大多数植物的选择是直接不改变原有的光合系统。
还有，基因和环境共同决定生物性状，光合系统的屎山逻辑同时也说明其对应的基因也是屎山。
