题主想法很好，已经有一些研究结果证实了这个现象。曾经在组会分享过做相关研究的文献，时间有点久只能凭印象大概说说。
癌症难以控制的一大原因就是自身免疫系统缺乏对癌细胞的识别和清除能力。首先由于癌细胞是病变的自体细胞，导致其天然缺乏抗原性，不易被免疫系统识别；其次，在癌细胞积累突变的过程中部分癌细胞获得了分泌具有免疫抑制活性能力的能力，在与免疫细胞斗智斗勇的过程中，这部分癌细胞由于更容易躲过免疫细胞的杀伤从而存活下来，大量繁殖，并靠着分泌的免疫抑制物质在自身周围形成一个「免疫豁免区」。
于是，一些科学家产生了和题主一样的想法，并且进行了实验，把一些细菌稀释之后注射到动物中。实验人员设计了这样一种特殊的细菌：在数量比较多密度比较大的时候会「自杀」裂解，释放内容物，而细菌内容物的蛋白的抗原性是显著强于表面蛋白的，更容易引起免疫系统的注意。将这种细菌注射到动物里会发生的事情：刚刚介绍过，由于很多癌细胞具有分泌免疫抑制物质的能力，会在癌组织处形成一个「免疫豁免区」，导致细菌会天然在癌组织处富集，或者应该说因为其他地方的细菌被免疫系统杀掉了而癌组织附近的细菌被癌细胞分泌的物质保护而存活下来，这些富集的细菌触发了「自杀」机制，释放出高抗原性的内容物，反过来吸引免疫系统的注意，从而在癌组织处局部增强免疫系统的活性，达到杀灭癌细胞的效果。应该说实验是获得了比较明显的效果的，癌组织确实变小了。至于后续这个疗法有没有推广，或者有没有什么弊端是研究者刻意回避的，我没有跟进，就没法介绍太多了。
不过实验所用到的细菌都是对生物体无害的细菌，并且注射浓度很低，否则对象还没来得及死于癌症就先死于败血症了。所以题主所说的靠细菌毒素杀死癌细胞的是比较困难的，毕竟癌细胞一般是比正常组织细胞要更坚强一些的，想杀死癌细胞肯定会先影响正常细胞。
总结：一些研究表明细菌确实具有一定的抗癌的效果，不过方式不是通过题主所说的细菌分泌毒素直接杀死癌细胞，而是通过利用细菌富集在癌组织形成的免疫豁免区，从而提高局部的免疫系统活性实现的。不过这种动物模型里统计学有效的抗癌疗法有很多，真正能够走向成熟进入临床的占比很小很小，个人对这个疗法的前景不是很看好，至少短期内不会成为一个主流的临床治疗方法。
参考文献：Programmable bacteria induce durable tumor regression and systemic antitumor immunity. <nature medicine>
