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达安基因申请探针设计相关专利,探针在目标物种参考基因序列上覆盖率好时减少设计数量

2024-10-19科学

金融界2024年10月18日消息,国家知识产权局信息显示,广州达安基因股份有限公司申请一项名为「探针设计方法、电子设备以及计算机可读存储介质」的专利,公开号 CN 118782147 A,申请日期为2024年6月。

专利摘要显示,本发明实施例提供了一种探针设计方法、电子设备以及计算机可读存储介质,涉及生物信息技术领域。探针设计方法,包括:获取目标物种的参考基因序列,并对所述参考基因序列进行Kmer滑窗得到所述参考基因序列的Kmer序列集合;将所述Kmer 序列集合中的各Kmer序列分别回贴到所述参考基因序列上,并基于所述参考基因序列上各个位置的Kmer序列重叠深度,在所述参考基因序列上选取满足深度要求的目标序列;针对所选取的所述参考基因序列上的所述目标序列,设计对应的探针。本发明中所设计的探针在目标物种的参考基因序列上覆盖率较好的情况下,减少所设计探针的数量,兼顾了检测灵敏度与经济性。