一種觀點認為，廈門大學醫學院也辦了二十多年了，但在省內的認可度，還是不如雙非的福建醫科大學。事實上，廈門的醫療水平都無法給廈大提供一個相對品質高的附院，或者說，廈大目前也無法提升廈門的醫療水平，和福州比起來差距明顯……
對此觀點基本認同，廈大醫學院成立至今，基礎科研領域已經有了很大的進步，和頭部醫學院的差距也沒那麽大了，唯一的短板就在於臨床。而制約臨床發展的核心因素就是附屬醫院（數量、臨床&科研水平）。
如果想建設高水平的臨床體系，直屬附屬醫院必不可少。市一、中山兩所非直屬醫院，掛了學校的牌子十幾年也沒轉成直屬，既然現在已經有了直屬醫院（雖然是新建，地域、知名度等均無優勢），那麽學校也不得不把重心都放在直屬醫院上。
這並不完全是因為受到引進外部高水平醫院分院的刺激，而是學校依據現實情況，對大醫科發展制定的無奈之舉。從現有的發展趨勢來看，只要那兩所不能成直屬，不管外部引進多少頂尖醫院來開分院，他們的水平/排名都會居於福州的三所之下，當地的醫療水平也不可能趕得上福州。
看看今年發生的疫情，還是暴露了廈門醫療水平不高，數量不足的問題，第一和廈大中山發生院感封院，要不是這些年新開的翔安、復旦、弘愛頂上去扛了幾天，後果不敢想象。
廈門大學醫學院引爭議：省內認可度不如雙非的福建醫科大學？借用韓院士的一句話：「只有廈大醫科名列全國的前茅，廈門的醫療服務才有可能成為國內一流，這裏沒有捷徑。」
